当地时间3月8日，莫斯科巴斯曼区法院对两名涉嫌枪杀俄前副总理、反对派政治家涅姆佐夫的嫌疑人正式提出指控。此外，还有另外三名嫌疑人也已被法院正式逮捕。除目前被羁押的5人外，还有一名嫌疑人在7日的逮捕行动中与警方发生交火，随后引爆炸弹自尽。

据报道，此次受到指控的两人分别是绍尔·达达耶夫和安佐尔·库巴舍夫，都是高加索人。据俄安全部门消息人士说，涅姆佐夫遇害后，调查人员根据现场目击者描述，掌握了嫌疑人体貌特征，并在侦办过程中发现嫌疑人实施犯罪时所驾驶的车辆。调查人员以此为突破口，发现嫌疑人生物学信息，进而锁定目标。

8日当天，两人在严密的安保中被带上法庭，整个上午，莫斯科法院附近都有装甲车以及佩戴武器的警察。在庭审期间，达达耶夫承认了自己的罪行。另外4人则声称自己无辜。

本月7日，达达耶夫和库巴舍夫在俄印古什共和国被捕，一同被捕的还有安佐尔·库巴舍夫的弟弟沙吉德·库巴舍夫。俄罗斯印古什共和国安全委员会主席阿尔贝特·巴拉霍耶夫7日晚些时候接受媒体采访时说，库巴舍夫当天驾车从马尔戈别克前往他母亲所住的一个村庄时被抓获，达达耶夫在另一座城市马加斯被捕。

巴拉霍耶夫还说，库巴舍夫和达达耶夫都在车臣共和国首府格罗兹尼拥有住房，平时住在那里。他们的家人也来自车臣共和国，上世纪60年代移居至印古什共和国一个村庄。

在此次被指控的两人中，达达耶夫的身份尤其引起了各方的注意。根据巴拉霍耶夫的说法，达达耶夫曾在车臣共和国特警部队“北方营”供职，并任一个小分队的副指挥官。早前有报道称，达达耶夫经常出现在车臣总统卡德罗夫的保镖团队中。车臣政府网站显示，达达耶夫2010年曾经被授予“勇敢勋章”。

车臣共和国领导人卡德罗夫表示，要对案件进行彻底调查，特别是要对嫌疑人达达耶夫在车臣服役期间情况以及其离开部队原因进行调查。他还称，达达耶夫对于法国漫画杂志《沙尔利周刊》讽刺伊斯兰教先知穆罕默德感到震惊。但达达耶夫的母亲则表示，她不相信自己儿子参与了这一事件。她说，达达耶夫近十年来一直在与车臣武装分子作战。

除7日被抓获的达达耶夫等3人外，另外两名嫌疑人哈姆扎德·巴哈耶夫和塔梅尔兰·兹斯凯尔汉诺夫于8日凌晨在莫斯科州奥金佐沃区被抓获。7日下午，俄警方发现第6名嫌疑人、30岁的别斯兰·沙瓦诺躲藏在车臣首都格罗兹尼市一座建筑物内，随后对该建筑物进行包围，沙瓦诺起初尝试突围，朝警方扔了一个手榴弹，然后引爆炸弹自杀。

8日庭审当天，俄安全部门表示，虽然已抓获5名凶嫌，但鉴于此次谋杀有“买凶杀人”的性质，侦查机关将继续追捕此案的参与者。

虽然根据俄官方说法，涅姆佐夫遇刺案已有较大进展，但目前的调查结果却也遭到了俄国内反对派和西方的质疑。“莫斯科为什么又把线索指向高加索？”德国《法兰克福评论报》称，俄罗斯过去几年发生的数起刺杀案最后凶手都来自高加索地区，但这些答案不能令国际社会信服。