当地时间11月7日，在首都墨西哥城召开的记者会上，墨西哥总检察长穆里略·卡拉姆详细通报了伊瓜拉学生失踪案调查进展。他说，落网黑帮组织成员供认，六星期前失踪的43名学生已遭杀害，凶案主谋正是此前被捕的伊瓜拉市市长夫妇。面对这一举国震惊的调查进展，墨总统涅托7日发表声明，誓言彻查事件，将所有有关犯罪人员绳之以法。

在嫌犯承认杀害失踪学生的录像片段中，黑帮组织成员供认，他们从伊瓜拉市警方处接手43名学生后，将其装上几辆自动卸货卡车，开往邻近科库拉市一处垃圾填埋场。到达目的地时，车上学生已经有15人死亡，其余的人则被射杀。为了处理学生尸体（事实上此时部分学生尚未断气），凶手现场搭建了一个大型焚化架。因尸体数量太多，嫌疑人轮流给焚化架添加柴油、汽油、轮胎、木柴等助燃物，确保火势持续。

据供认，焚尸过程从午夜持续到第二天下午两三点，长达14个小时。为销毁证据，凶手把被害人所穿的衣物也一并焚毁。最后，遇害学生遗骸被装入黑色垃圾袋，投入附近的圣胡安河。

录像显示，在嫌犯所说的河域和垃圾场附近，调查人员确实找到了装有烧焦残骸的黑色塑料袋。但卡拉姆表示残骸身份仍有待最后认定，除非有DNA鉴定证实遗骸的身份，否则当局将继续将这40多名学生的下落列为失踪。

比黑帮令人瞠目的残忍行径更让人毛骨悚然的是，案发地伊瓜拉市公职人员在这一屠杀事件当中的深度参与、甚至是直接指使。据路透社报道，墨西哥当局迄今已逮捕74人，其中包括伊瓜拉市市长夫妇及数十名当地警察。此外，报道还指出，前市长阿瓦尔卡夫妇是该市“土皇帝”，但伊市真正说了算的并非市长本人，而是其妻、别号“谋杀第一夫人”的皮内达；后者有三名兄弟是地方黑帮老大，她本人及其丈夫也是犯罪网络要员。

根据墨总检察长卡拉姆在记者会上对案件的还原，9月26日，数十名男性师范大学学生来到格雷罗州伊瓜拉市，为保护乡村教师权益举行示威游行并筹款；在他们搭乘强行征用的巴士返家时，与奉市长阿瓦尔卡命令前往拦截的警察发生冲突，后者随即开枪，当场造成6名学生死亡，20多人受伤。除15名学生幸运逃跑外，其余43人被带上警车，随后被警察移交给当地贩毒集团并惨遭屠杀。

根据调查，阿瓦尔卡之所以要对学生痛下杀手，是因为担心他们会破坏阻挠其妻即将发表的一次演讲。尤为讽刺的是，后者竟是当地一个儿童保护机构的负责人。

43名大男孩莫名失踪之后，墨警方随即展开调查，但其间过程一度扑朔迷离。10月4日，调查人员在伊瓜拉市附近发现群尸坑，找到28具尸体，但随后又称遗骸不属于失踪学生。10月6日，总统涅托下令总检察长接管案件调查，同时联邦军警接管伊瓜拉市治安，并解除了当地警察部队武装。10月17日，黑帮组织“联合战士”头目落网，他指称此前已弃职逃亡的伊瓜拉市前市长阿瓦尔卡及其妻皮内达是案件主谋。11月4日，藏匿在首都墨西哥城的阿瓦尔卡夫妇被抓获。

自上月初以来，出于对学生失踪案件的震惊及政府调查进度迟缓的不满，墨西哥多地爆发了民众示威游行。10月8日，在首都墨西哥城和案发州首府奇尔潘辛戈，分别有数千民众走上街头抗议政府调查不力及官员与犯罪分子的勾结；在案件发生的格雷罗州，主要由教师和学生组成的抗议人群在此后几天里持续示威，占领了多个城市的市政大厅，并与警方发生冲突；11月8日，在墨政府宣布最新调查结果后，民众的愤怒达到了极点，示威者们在墨西哥南部焚烧数辆汽车，并投掷燃烧弹；而在墨西哥城，示威者大呼着“涅托下台”，试图冲入国家宫——这里是墨西哥联邦行政机构所在地与总统办公地点，在遭到阻拦后，他们在国家宫门前放火，并喷上了“我们希望他们活着回来”的抗议标语。

长期以来，猖獗的大规模有组织犯罪活动一直是墨西哥难去的毒瘤。主要由贩毒集团组成的黑帮组织，拥有堪与墨正规军相媲美的庞大武装力量和先进军事装备。虽然墨西哥政府屡屡誓言打击黑帮，但每年仍有多达数万人遇害，从网上留言表达不满的普通民众到警察局长、市长、州长，从全副武装的警察、特警到训练有素的正规军士兵，黑帮的残忍杀害无处不在。