日本民主党4日上午召开众参两院议员全体会议，举行该党代表选举。菅直人在选举中击败竞选对手，当选该党新代表。随后，菅直人于当天下午在国会众参两院首相指名选举中当选新一任首相，接替此前宣布辞职的前首相鸠山由纪夫。分析人士认为，挽回民心，应对鸠山政权遗留下的复杂局面，将是菅直人上台后不得不面对的难题。

由于驻日美军普天间基地迁移、社民党退出执政联盟、政治献金等问题，日本首相鸠山由纪夫4日上午在内阁会议上接受所有内阁大臣的辞呈，随后宣布内阁总辞职。因此，可以说，菅直人是受命于“危难之中”。

菅直人曾10次当选众议员，与小泽、鸠山一起，被公认为是民主党的三驾马车，并多次出任党首等重要职务。菅直人个性鲜明，在出任厚生劳动大臣时，曾力排众议，责令政府彻底追查由药物引起的艾滋病问题，并向受害者谢罪，使得他在百姓中颇有人气。但是，考虑到鸠山留下的一大堆难题，菅直人上台后也将面临一系列挑战。

首先是要修补日本因为政权频繁更迭而受损的国际形象。菅直人6月下旬将以新一任日本首相身份出席在加拿大举行的八国集团峰会（Ｇ8），2007年以来，每年出席八国峰会的日本首相均是新面孔。日本各界担心，首相的频繁更替会导致世界各国领导人对日本政权缺乏信赖。

其次，是要缓和冲绳等县的民众情绪，协调各党派力量，落实日美两国关于普天间基地搬迁问题共同声明的内容。日美两国5月28日发表共同声明，决定将普天间基地搬迁到冲绳县名护市边野谷地区，此举遭到冲绳等县居民的严厉谴责和坚决抵制，社民党甚至不惜以退出联合政权来表示强烈反对。该声明虽然以两国政府文件的形式确定下来，但如填海造地、修建机场等还需要得到当地政府的同意。此外，作为美军直升机部队训练项目的拟定搬迁地，鹿儿岛县德之岛的民众也在极力抗争。该共同文件如何落实，将成为菅直人政权无法回避的一个难题。

再者，菅直人还需要抓紧时间整合党内各派力量，体现自身的执政影响力。民主党内目前主要分为以前民主党干事长小泽一郎为首的小泽派和以前国土交通相前原诚司、前外务相冈田克也为代表的反小泽派，两派势力基本势均力敌。要恢复民众信赖，就必须同政治献金丑闻问题划清界限，菅直人在当选首相前曾暗示不会再任用在此问题上具有污点的小泽担任要职。分析人士认为，这是菅直人为迎接7月参院选举，而突出表现要和小泽划清界限的一种新立场。虽然菅直人当选首相，得到了两派势力的共同支持，但今后能否协调处理好两派力量之间的关系，同时体现出自身的执政影响力，还需要观察。

最后，菅直人还要为将于7月份举行的参议院选举作充分的准备，并带领民主党在这次选举中获胜。虽然鸠山政权已经辞职，但日本民众对民主党的不信任感短期内难以消除。现在距离7月参议院选举只有短短的一个月时间，如何能在短短一个多月的时间力挽狂澜，重建国民对于民主党的信赖，对菅直人来说确实是个不小的考验。