２００９年１月１日捷克正式接替法国担任欧盟轮值主席国。捷克是继斯洛文尼亚之后，第二个新入盟国家中担任欧盟轮值主席国的国家。在为期６个月的任期内，捷克面临着应对世界金融危机和推进欧盟政治改革等问题，这对入盟不久的小国来说任务艰巨，面临着许多挑战和考验。

捷克总理托波拉内克去年１１月在布拉格举行的捷克担任欧盟轮值主席国标志揭幕仪式上说，捷克在就任轮值主席国期间需要优先解决三个方面的问题，一是经济发展和解决金融危机问题；二是全球气候变暖问题；三是欧盟的外交政策问题。

捷克是在世界金融危机的背景下上任欧盟轮值主席国的。截至目前欧盟虽然已推出２０００亿欧元的救市计划，但各成员国之间存在着巨大的政策分歧。因此，捷克一方面要努力协调成员国之间关系，以使欧盟国家能有效地应对危机；另一方面还要避免被人怀疑实行保护主义和过度干预别国的经济。这对入盟不到５年的欧盟小国来说是个考验。

作为欧盟轮值主席国，继法国之后，捷克将继续着手解决被爱尔兰全民公决否决的《里斯本条约》问题。但捷克迄今也未批准《里斯本条约》，在这种情况下就很难理直气壮地说服爱尔兰批准条约。

在中东问题上，以色列近日对加沙发动的大规模袭击已造成重大人员伤亡，许多国家和国际组织纷纷对以进行谴责，要求立即停火，虽然捷克宣布将同时举行欧盟—以色列峰会和欧盟—巴勒斯坦峰会进行斡旋，但分析人士认为，由于捷克是美国的盟友，长期以来，美国一直在中东问题上偏袒以色列，巴以武装冲突发生后，捷克曾公开支持以色列对加沙采取的军事行动，因此捷克要在中东问题上进行斡旋，促使冲突双方停火对话并非易事。

就在捷克上任欧盟轮值主席国的第一天，由于俄罗斯和乌克兰有关２００９年天然气供应问题的谈判破裂，俄方当天已完全中断对乌克兰的天然气供应。这对新上任的欧盟轮值主席国捷克来说是当头一棒。因为欧盟国家四分之一的天然气需求来自于俄罗斯，而俄输往欧盟国家８０％的天然气必须途经乌克兰，俄乌两国关于天然气价格和天然气债务问题的争端涉及到许多欧盟国家的利益，因此如何协调解决好上述问题对欧盟新掌舵人来说也是一项考验。

加强与美国当选总统奥巴马新政府之间的关系也是捷克在欧盟轮值主席国任期内的重要任务之一。捷克计划今年春末在布拉格召开首次欧盟—美国峰会，以加强欧盟与美国在经济、军事和安全方面的合作。捷克还计划扩大与加拿大的关系，并在不久的将来与加拿大签署有关自由贸易的协议。

舆论注意到，欧盟轮值主席国的主要作用是使欧盟的各种建议得到大多数成员国的支持，但捷克国内就存在对欧盟持怀疑态度的强大势力，其主要代表人物就是捷克总统克劳斯。因此，捷克在一些有争议的问题上是否能说服欧盟其它国家，还有待观察。