2009年4月,成立第一家孵化器“北京牡丹科技孵化器有限公司”,在系统内开创开展科技孵化产业先河。2011年12月,牡丹科技孵化器被正式认定为“北京高新技术产业专业孵化基地”。2012年牡丹科技孵化器(牡丹园)被科技部认定为国家级孵化器,之后被工信部认定为国家小型微型企业创业创新基地,成为牡丹园区建设的重要标志。2015年,牡丹创新孵化器被科技部认定为国家级科技孵化器。图为牡丹科技孵化器(牡丹园)实景图。